黃腐酸可以在土壤中形成膠狀物質(zhì)，將土壤顆粒膠結(jié)起來(lái)，從而增加土壤中的水穩(wěn)性團(tuán)粒，促進(jìn)團(tuán)粒結(jié)構(gòu)形成，同時(shí)還可以疏松土壤，提高土壤的保水保肥能力。黃腐酸是一種弱酸，與鉀、鈉、銨等一價(jià)陽(yáng)離子可以形成溶于水的弱酸鹽類，組成緩沖溶液，從而當(dāng)外界酸性或堿性物質(zhì)進(jìn)入土壤之中時(shí)，能夠在一定程度上維持土壤原ph，保持大致不變，為作物提供一個(gè)穩(wěn)定的生長(zhǎng)環(huán)境。黃腐酸是氮肥的緩釋劑和穩(wěn)定劑，磷肥的增效劑，鉀肥的保護(hù)劑（對(duì)于氮元素，黃腐酸可以減少氮素?fù)]發(fā)，促進(jìn)氮的吸收，同時(shí)加快有機(jī)氮礦化速度，提高土壤氮含量。對(duì)于磷元素，黃腐酸可以降低土壤對(duì)于磷的固定作用，讓土壤中的難溶性磷轉(zhuǎn)化為有效磷，同時(shí)增加磷元素在土壤中的移動(dòng)距離。對(duì)于鉀元素，黃腐酸可以減少土壤對(duì)于鉀的吸收固定，同時(shí)促進(jìn)難溶性鉀的釋放，增加鉀含量）。使用之后，可以增加土壤養(yǎng)分含量，減少土壤養(yǎng)分流失，促進(jìn)作物吸收養(yǎng)分，提高肥效，同時(shí)還能增強(qiáng)作物的抗寒、抗旱、抗鹽堿能力。

黃腐酸肥含有多種官能團(tuán)，可以刺激作物的生長(zhǎng)發(fā)育以及生理代謝。主要表現(xiàn)為：促進(jìn)種子萌發(fā)，刺激根部生長(zhǎng)發(fā)育，促進(jìn)根部呼吸，增強(qiáng)根系活力，從而增強(qiáng)作物對(duì)于養(yǎng)分的吸收能力，同時(shí)還可以促進(jìn)葉綠素形成以及植物中糖和氨基酸的形成，從而增強(qiáng)作物的光合作用和呼吸作用強(qiáng)度。

黃腐酸肥可以和汞、砷、鎘、鉻、鉛等重金屬形成難溶性物質(zhì)，從而降低重金屬對(duì)于作物的危害。